南堡寨村是一個古老的村莊，建于清朝嘉慶年間，當時屬于咸寧縣杜曲社管轄。那時，關中地區(qū)回民起義，兵荒馬亂，南堡寨就是一座易守難攻的堡寨。

20世紀90年代，南堡寨村已有上百戶人家搬到神禾原下。2000年，該村村委會決定，全村搬到原下。2009年該村被評為新農(nóng)村建設示范村。

現(xiàn)在的南堡寨山清水秀，風景秀麗，一派江南的景象。全村有五個村民小組，共有382戶，1469人，耕地有1100余畝，主產(chǎn)小麥、玉米、稻谷、油菜等。

2020年8月，南堡寨村入選第二批全國鄉(xiāng)村旅游重點村名單。