春秋時屬晉，晉平公二年（前556），將祁地賜給姬奚，后改為祁奚，城邑在古縣鎮(zhèn)。

晉頃公十二年（前514），祁奚孫祁盈因罪被殺。

今祁奚為郡，祁平陵，梗陽，涂水，馬首，盂七縣。

戰(zhàn)國時屬趙，秦始皇統(tǒng)一后，分天下為36郡，祁地屬太原郡。

西漢初置祁縣，仍屬太原郡。

王莽改祁為示，隸屬不變。

東漢初，復稱祁縣，仍屬太原郡。

三國屬魏國，屬并州太原郡。

西晉初，祁屬太原國。

西晉末年，先后被前趙、后趙、前燕、前秦、西燕、后燕統(tǒng)治。

南北朝、北魏時屬并州太原郡。

北魏時屬太原郡。

北齊天保七年（556）裁祁縣。

隋開皇十年（590）復置祁縣，屬并州。

唐武德三年（620）于太谷置太州，祁縣屬太州。

六年（623）廢太州，仍屬并州。

唐開元十一年（723）改并州為太原府，祁縣屬太原府。

五代十國，先后屬后唐、后晉、后漢及北漢。

宋太平興國四年（979）北宋滅北漢，屬并州。

嘉祐四年（1059）改并州為太原府，屬太原府。

天會六年（1128），屬河東北路。

貞祐元年（1213）在祁縣東南南團柏鎮(zhèn)置幘州，祁縣屬幘州。

貞祐四年（1126）廢幘州，改屬太原府。

興定四年（1220）屬晉州。

元初復稱祁縣，廢晉州，屬太原路。

元大德九年（1305）改太原路為冀寧路，祁縣隸屬不變。

明屬太原府，清屬冀寧道太原府。

1911年撤道、府建置，直屬山西省。

1913年，于省縣之間設道，屬中路道。

1927年廢道，直轄于山西省。

1937年底，屬山西省第四行政區(qū)。

1938年4月屬第三行政區(qū)，9月同時屬第三，八行政區(qū)。

1939年11月屬共產黨太行區(qū)第三專署。

1946年太行六個專區(qū)，合并為四個專區(qū)，祁縣屬二區(qū)。

1948年7月7日祁縣解放。

1950年8月，屬榆次區(qū)專員公署。

1955年2月，屬榆次專員公署。

1958年屬晉中專員公署，11月10日祁縣太谷合并，稱太谷縣，仍屬晉中專員公署。

1961年5月1日祁縣、太谷分設，恢復原建置，隸屬不變。

1978年5月，成立山西省晉中地區(qū)行政公署，縣屬不變。

1999年9月24日，經國務院批準，撤銷晉中地區(qū)成立晉中市，祁縣屬晉中市。