秦廢金陵邑，于此置秣陵縣，因此得名。

漢初為秣陵縣；西漢元朔元年（前128）改秣陵侯國，后復為縣；王莽新朝改稱宣亭縣；東漢復舊名。

孫吳稱建業(yè)縣。

西晉復稱秣陵縣。

隋開皇九年（589）廢入江寧縣。

轄境宋代屬馴翚鄉(xiāng)、隨車鄉(xiāng)、萬善鄉(xiāng)、開元鄉(xiāng)、朱門北鄉(xiāng)。

北宋景德二年（1005）始置秣陵鎮(zhèn)，設有秣陵驛、秣陵鋪。

元代設秣陵巡檢司。

明代置稅關，稱秣陵關。

清代秣陵鎮(zhèn)號為江寧縣三大鎮(zhèn)之一。

民國初稱秣陵市。

1928年名秣陵鎮(zhèn)。

1949年4月沿之。

1958年秣陵鎮(zhèn)改秣陵人民公社。

1982年改設秣陵鄉(xiāng)。

1989年1月撤秣陵鄉(xiāng)改設秣陵鎮(zhèn)。

2004年8月撤秣陵鎮(zhèn)改設秣陵街道至今。