秦始皇二十六年（前221）設(shè)零陵縣，治今全州縣西南，轄今全州、興安、資源、灌陽(yáng)、靈川等縣地，為今市境二級(jí)政區(qū)之始，屬長(zhǎng)沙郡；其余屬桂林郡地。

西漢元鼎六年（前111）置始安縣，治今桂林市區(qū)，轄今桂林城區(qū)和陽(yáng)朔、龍勝、靈川等縣地，和零陵縣同屬零陵郡，其余屬蒼梧郡地。

三國(guó)吳甘露元年（265），析零陵郡置始安郡，治始安縣。

郡為地方二級(jí)政區(qū)，今桂林市境分屬始安、零陵、蒼梧等郡地。

兩晉分屬始安、零陵、蒼梧、桂林等郡地。

南朝梁天監(jiān)六年（507）分廣州置桂州。

大同六年（540）移桂州州治于始安縣（今桂林市區(qū)），今市境仍屬始安、零陵、蒼梧、桂林等郡。

隋為始安、零陵郡地。

唐廢郡置州，為桂州、昭州、永州地。

北宋至道三年（997），桂州為新置的廣南西路治，桂林首次為廣西首府。

南宋紹興三年（1133），升桂州為靜江府，今市境屬?gòu)V南西路靜江府、昭州和荊湖南路全州地。

元改昭州為平樂(lè)府，改全州為全州路，改靜江府為靜江路，今境屬?gòu)V西中書(shū)省靜江路、平樂(lè)府和湖南中書(shū)省全州路地，靜江路為廣西中書(shū)省治。

明洪武元年（1368）改靜江路為桂林府，洪武二十七年（1394），湖廣永州府全州、資源、灌陽(yáng)等縣劃歸桂林府，今市境屬?gòu)V西承宣布政使司桂林府、平樂(lè)府地，桂林府為司治。

清仍為桂林府、平樂(lè)府地，桂林府為廣西省治。

1913年廢桂林、平樂(lè)2府，設(shè)漓江道，屬?gòu)V西省，省會(huì)遷邕寧道。

1914年漓江道更名桂林道。

1930年改設(shè)為桂林、平樂(lè)2民團(tuán)區(qū)。

1934年改為桂林、平樂(lè)2行政監(jiān)督區(qū)。

1936年省會(huì)遷回桂林。

1939年，劃桂林縣城和附廓置省轄桂林市。

1940年為桂林市和第一行政督察區(qū)、第二行政督察區(qū)。

1944年為桂林市和第八行政督察區(qū)、第十四行政督察區(qū)。

1949年12月桂林市為省轄市，成立桂林專區(qū)、平樂(lè)專區(qū)，省會(huì)遷南寧。

1958年7月撤銷(xiāo)平樂(lè)專區(qū)，將其所轄的平樂(lè)縣、荔浦縣、恭城縣、灌陽(yáng)縣劃歸桂林專區(qū)，屬?gòu)V西僮族自治區(qū)。

1960年7月桂林市由桂林專區(qū)代管，桂林市和桂林專區(qū)合署辦公。

1961年5月，桂林市復(fù)為自治區(qū)轄市。

1965年屬?gòu)V西壯族自治區(qū)。

1971年11月，桂林專區(qū)改桂林地區(qū)，今市境為桂林市和桂林地區(qū)。

1981年、1983年，原桂林地區(qū)陽(yáng)朔縣和臨桂縣先后劃入桂林市。

1998年8月，桂林市、桂林地區(qū)合并，成立現(xiàn)桂林市。

2013年臨桂縣改臨桂區(qū)，市人民政府駐地由象山區(qū)遷至臨桂區(qū)（文件批復(fù)時(shí)間為2013年，市人民政府實(shí)際于2014年正式搬遷至臨桂區(qū)）。

2018年下轄的荔浦縣改為荔浦市。