明代前已形成村落，有下隘門、周家灣（甘草灣）、馬家山灣、孟家大灣。

明、清時屬永昌衛(wèi)（縣）寧遠堡（北鄉(xiāng)）。

民國時為永昌縣寧遠鄉(xiāng)（區(qū)）五保。

1949年解放初為永昌縣第四（寧遠）區(qū)三鄉(xiāng)。

1952年屬永昌縣第五（寧遠）區(qū)五（龍景）鄉(xiāng)。

1956年1月撤區(qū)并鄉(xiāng)屬永昌縣寧遠堡鄉(xiāng)，當年由三個初級農業(yè)合作社并為紅旗高級農業(yè)合作社。

1958年9月鄉(xiāng)改為人民公社，高級農業(yè)合作社改為生產大隊。

是年11月，并入金川公社，為該公社寧遠大隊山灣生產隊。

1961年金川公社撤銷，建立寧遠堡公社，為寧遠堡公社山灣大隊。

1968年改名紅星公社紅光大隊，1970年恢復原名。

1981年劃入金昌市屬寧遠堡公社。

1983年政社分設改為寧遠堡鄉(xiāng)山灣村村民委員會，轄4個村民小組，村委會駐地馬家山灣。

1984年屬金川區(qū)寧遠堡鄉(xiāng)。

1999年12月撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，改為寧遠堡鎮(zhèn)山灣村沿用至今。

2007年3月設立山灣村社區(qū)工作委員會。

2013年設立村務監(jiān)督委員會。

村民委員會、村社區(qū)工作委員會、村務監(jiān)督委員會一套人馬三塊牌子合署。