西漢時(shí)期始設(shè)昌平縣。
明正德元年（1506）縣升為州，公元1913年撤州設(shè)縣。
1949年4月昌順聯(lián)合縣分社昌平縣，屬察哈爾省南口專(zhuān)區(qū)；8月1日起屬河北省通縣專(zhuān)區(qū)。
1956年3月9日國(guó)務(wù)院全體會(huì)議第25次會(huì)議決定：撤銷(xiāo)昌平縣，將昌平縣所屬行政區(qū)域（高麗營(yíng)鎮(zhèn)除外）劃歸北京市，并命名為昌平區(qū)。
1960年1月7日國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)，撤銷(xiāo)昌平區(qū)，恢復(fù)昌平縣。
1999年9月16日，《國(guó)務(wù)院關(guān)于同意北京市撤銷(xiāo)昌平縣設(shè)立昌平區(qū)的批復(fù)》國(guó)函〔1999〕112號(hào)，撤銷(xiāo)昌平縣，設(shè)立昌平區(qū)，以原昌平縣的行政區(qū)域?yàn)椴絽^(qū)的行政區(qū)域，區(qū)人民政府駐政府街。
2022年，昌平區(qū)下轄8個(gè)街道、14個(gè)鎮(zhèn)。